Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Irx1P81068 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms