Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irx3P81067 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms