Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sparcl1P70663 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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