Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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