Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms