Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp1P59054 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms