Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dpf3P58269 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dpf3P58269 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dpf3P58269 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms