Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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