Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrp1P56183 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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