Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TspoP50637 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TspoP50637 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TspoP50637 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms