Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SftpdP50404 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms