Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmod1P49813 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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