Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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