Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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