Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
VhlP40338 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VhlP40338 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VhlP40338 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms