Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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