Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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