Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms