Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcdP28867 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms