Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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