Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Xrcc5P27641 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Xrcc5P27641 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Xrcc5P27641 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Xrcc5P27641 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Xrcc5P27641 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc5P27641 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms