Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms