Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkchP23298 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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