Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PparaP23204 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PparaP23204 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms