Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpcP21841 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SftpcP21841 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms