Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Fcer1aP20489 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Fcer1aP20489 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Fcer1aP20489 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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