Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfaP20033 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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