Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms