Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18529 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18529 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18529 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18529 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18529 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms