Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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