Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms