Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb1P12658 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb1P12658 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb1P12658 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms