Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms