Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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