Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CcnkO88874 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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