Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BlmO88700 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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