Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a1O88207 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms