Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.6 ms