Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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DffaO54786 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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DffaO54786 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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DffaO54786 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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DffaO54786 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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DffaO54786 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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DffaO54786 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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DffaO54786 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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