Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nek2O35942 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nek2O35942 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nek2O35942 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms