Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms