Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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