Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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