Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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