Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SdcbpO08992 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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SdcbpO08992 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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