Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms