Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms