Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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