Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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