Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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